Организация «Хронос», стремящаяся к миру во всём мире, контролирует треть экономики планеты. Эта организация необходима для поддержания баланса в мире, и поэтому нужно её охранять. С этой целью на «Хронос» работают тринадцать элитных убийц, которых называют Номерами Хроноса. Каждый из них владеет уникальным оружием, выкованным из редкого сплава ртути, свинца, олова, меди, серебра, золота и стали — орихалкона, для плавки которого необходимо особое положение звезд, поэтому его можно получить раз в 25 лет.

Главный герой сериала — Трейн Хартнет, Тринадцатый Номер Хроноса, также печально известный как Чёрный Кот. После недолгого знакомства с Чистильщиком (лицензированным охотником за головами) по имени Сая Минацуки Трейн перестаёт придерживаться морали и ценностей «Хроноса», сменяя их на свои собственные. Вместо того чтобы убивать своих жертв по приказам «Хроноса», Трейн просто оглушает их с помощью Гадеса (своего орихалкового пистолета). Это ухудшает отношения между ним и лидерами «Хроноса», и в конце концов Трейн покидает организацию. Крид Дискенс, очень привязанный к нему, недоволен тем, что Сая изменила жизнь Чёрного Кота, и убивает её.